1）创新的教育培养模式
WISE的课程体系是由院学术委员会根据北美一流研究型大学课程设置模式和要求结合中国高校经济类教学的实际，制定，总体课程设置包括核心课程(Core Courses)和前沿课程（Advanced Courses）（详见课程介绍）。并通过小班上课、讨论经典和最新文献等，使学生尽快扎实地掌握学科最前沿知识，尽快选题和进入研究。WISE还为研究生撰写了学习、生活指南（详见培养管理部分的学习生活指南）。
2）先进的导师组培养制度
WISE博士研究生由导师组负责指导培养，即博士研究生入学时不确定导师，经过一年的核心课程学习后基于“双向选择”确定导师组。导师组“双向选择”制度有利于整合资源，以导师们的集体智慧来培养高质量的博士生。
3）充分的学制保障
WISE从2007级博士生开始，实行与国际接轨的博士生四年制培养学制。旨在鼓励博士研究生从事原创性的理论与方法研究。WISE在厦门大学三年奖学金制度的基础上，大幅度提高四年级及四年级以上博士研究生的资助额度，资助采取奖学金和助教津贴两种形式。
4）前沿的学术讲座开展平台
WISE邀请海内外学术界知名学者与实业界成功人士每周开设前沿学术讲座系列，包括高级经济学系列、“WISE-IZA”劳动经济学系列、职业发展规划系列、现代经济研究青年学者论坛、统计学高级系列讲座，“WISE-经济学院”双周青年论坛，学科入门讲座以及各类学术沙龙。同时，WISE还在每学期开设特设《博士生研讨会》、“午餐研讨班”（Lunch Seminar）和学习小组（Study Group），由WISE优秀的海归教授主持，对于博士生学术研究进行答疑解惑并给予充分的指导。
5）丰富的海内外学术交流
WISE聘请大量国外一流大学的一流学者定期或不定期地来校讲学，并积极探索各种形式的合作研究、合作办学和交流。为WISE博士生提供了洪堡大学（IRTG）、欧盟伊拉斯莫斯、爱尔兰都柏林大学等出国交流访学的机会。此外，WISE还对博士研究生参加国内学术会议给予资助。
6）严格的教学管理体制
WISE实施严格的教学管理，为研究生课程配备教学助理，对选课学生课程相关问题进行答疑解惑，并同时严肃、及时的记录学生、作业、成绩等各项考核，辅助教学工作。每学期期末WISE定期对教学各个环节进行调查评估，并将评估统计结果反馈给任课教师和教学助理，通过“双向检验”，进一步提高教学质量。
7）优越的研究环境
除了提供数据与运算支持，即博士生征得导师支持可优先使用本院购置与建设的研究数据库资源，并可使用本院的高能计算机集群进行原创登陆的研究运算；WISE还为博士生提供工作市场与就业支持：学院组织资深教授对学生参加学术工作市场进行指导，组织报告工作市场论文、模拟工作面试，推荐就业渠道等。
