教育部社政司组织了全国社会科学领域的1000名教授对CSSCI来源期刊进行评选。评选具体方法是：由高校社会科学管理研究会致函1000名教授，详细说明了CSSCI来源期刊选定的原则、方法、程序，请专家根据自己对社科学术期刊的学术水平、学术影响的评判，从备选期刊表中按1.2:1进行挑选，可以少选，亦可推荐认为被遗漏的重要期刊。根据学科的大小分为3类，将学科备选期刊表分别送60、40、20位专家评选，而“社科总论”、“高校综合性社科学报”类备选期刊表则送1000名教授评选。
CSSCI来源期刊专家评选表由北京师范大学社科研究管理咨询服务中心进行回收和统计处理。此项工作得到了全国社会科学领域专家的大力支持，专家评选表回收率高达80%。北京师范大学社科研究管理咨询服务中心根据各学科备选期刊的得票多少排序得出CSSCI各学科来源期刊。对专家所推荐的期刊，由CSSCI项目组研究并请示教育部社政司。经过一系列工作，2001年7月底得出了专家评选的统计结果，经教育部社政司审定，确定CSSCI（2000）来源期刊共419种。
2004年全国高校CSSCI论文数前20位排序表
排序 学校名称 CSSCI论文数(篇)
1 中国人民大学 2003
2 北京大学 1981
3 北京师范大学 1727
4 武汉大学 1659
5 南京大学 1575
6 浙江大学 1570
7 复旦大学 1333
8 南开大学 1205
9 华东师范大学 1204
10 中山大学 1042
11 四川大学 1024
12 清华大学 1005
13 厦门大学 960
14 暨南大学 906
15 华中科技大学 838
16 吉林大学 761
17 南京师范大学 680
18 华中师范大学 649
19 山东大学 579
20 中南财经政法大学 520
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