厦门大学从2008级研究生起全面实行奖学金制度，根据每个院系招收学生数量统一确定各等级奖学金比例。对报考WISE的硕士研究生来说，从第二学年起，获得各等级奖学金的实际比例会比学校规定的比例高出很多。这是因为：WISE每年春季会从一年级的硕士生中，推荐一批优秀硕士生到新加坡管理大学（SMU）攻读经济学双学位。2006-2008年，WISE分别选派出7名、15名和12名硕士生到SMU学习一年半至两年，这些学生在新加坡学习期间均获SMU全额奖学金。同时，2008年还有两名WISE硕士生获欧盟全额奖学金到比利时安特卫普大学攻读“欧洲经济一体化”项目经济学双学位。这也就意味着二年级评定奖学金时，少了这部分人的竞争，很多硕士生都有可能拿到三等以上的奖学金，这些奖学金足以支付学费和部分生活费。此外，WISE二年级以上的研究生（硕士生和博士生）有很多助教和助研的工作机会。
厦门大学在 2009 年继续研究生培养机制改革，全面提高硕士研究生（不含委培生、在职生、 MBA 、法律硕士、单考生）的奖、助学金的金额和受益面， 100% 的学生可申请并获得奖学金。
附录一：厦门大学为 2009 级硕士研究生设立奖学金的数额：
1 、特等奖学金 5.1 万元（全程学费 3.3 万元，三年生活费 1.8 万元）；
2 、一等奖学金 1.7 万元（学费 1.1 万元 / 年，生活费 0.6 万元 / 年）；
3 、二等奖学金 1.5 万元（学费 1.1 万元 / 年，生活费 0.4 万元 / 年）；
4 、三等奖学金 0.4 万元（生活费 0.4 万元 / 年）。
附录二：WISE2008级硕士研究生奖学金分布情况：
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奖学金等级 |
名额（共计39人） |
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特等奖学金 |
2 |
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一等奖学金 |
8 |
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二等奖学金 |
14 |
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三等奖学金 |
15 |
厦门大学2009级硕士研究生奖学金名额比例暂时还未出台
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